Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Col4a3Q9QZS0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Col4a3Q9QZS0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms