Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE2

Clnk, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClnkQ9QZE2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ClnkQ9QZE2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ClnkQ9QZE2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ClnkQ9QZE2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms