Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ubxn8Q9QZ49 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubxn8Q9QZ49 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 280.4 ms