Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phtf1Q9QZ09 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Phtf1Q9QZ09 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms