Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Nphp1Q9QY53 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nphp1Q9QY53 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nphp1Q9QY53 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nphp1Q9QY53 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nphp1Q9QY53 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nphp1Q9QY53 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nphp1Q9QY53 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nphp1Q9QY53 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nphp1Q9QY53 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nphp1Q9QY53 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nphp1Q9QY53 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nphp1Q9QY53 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nphp1Q9QY53 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nphp1Q9QY53 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nphp1Q9QY53 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nphp1Q9QY53 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nphp1Q9QY53 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nphp1Q9QY53 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nphp1Q9QY53 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nphp1Q9QY53 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nphp1Q9QY53 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nphp1Q9QY53 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nphp1Q9QY53 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nphp1Q9QY53 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nphp1Q9QY53 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nphp1Q9QY53 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nphp1Q9QY53 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nphp1Q9QY53 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nphp1Q9QY53 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nphp1Q9QY53 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nphp1Q9QY53 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nphp1Q9QY53 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nphp1Q9QY53 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nphp1Q9QY53 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Nphp1Q9QY53 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nphp1Q9QY53 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nphp1Q9QY53 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nphp1Q9QY53 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nphp1Q9QY53 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nphp1Q9QY53 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nphp1Q9QY53 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nphp1Q9QY53 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nphp1Q9QY53 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nphp1Q9QY53 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nphp1Q9QY53 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nphp1Q9QY53 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nphp1Q9QY53 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms