Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY33

Tspan3, Tetraspanin-3, mousemouse

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Length 253 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan3Q9QY33 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Tspan3Q9QY33 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tspan3Q9QY33 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Tspan3Q9QY33 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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Tspan3Q9QY33 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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Tspan3Q9QY33 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tspan3Q9QY33 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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Tspan3Q9QY33 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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Tspan3Q9QY33 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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Tspan3Q9QY33 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tspan3Q9QY33 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tspan3Q9QY33 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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Tspan3Q9QY33 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tspan3Q9QY33 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tspan3Q9QY33 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tspan3Q9QY33 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tspan3Q9QY33 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tspan3Q9QY33 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tspan3Q9QY33 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tspan3Q9QY33 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tspan3Q9QY33 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tspan3Q9QY33 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tspan3Q9QY33 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tspan3Q9QY33 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tspan3Q9QY33 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tspan3Q9QY33 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tspan3Q9QY33 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tspan3Q9QY33 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms