Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp3Q9QY23 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms