Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trip4Q9QXN3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trip4Q9QXN3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trip4Q9QXN3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Trip4Q9QXN3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trip4Q9QXN3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trip4Q9QXN3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trip4Q9QXN3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trip4Q9QXN3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Trip4Q9QXN3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trip4Q9QXN3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trip4Q9QXN3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trip4Q9QXN3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trip4Q9QXN3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trip4Q9QXN3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trip4Q9QXN3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trip4Q9QXN3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trip4Q9QXN3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trip4Q9QXN3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trip4Q9QXN3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trip4Q9QXN3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trip4Q9QXN3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trip4Q9QXN3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trip4Q9QXN3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trip4Q9QXN3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trip4Q9QXN3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Trip4Q9QXN3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trip4Q9QXN3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trip4Q9QXN3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trip4Q9QXN3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trip4Q9QXN3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trip4Q9QXN3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trip4Q9QXN3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trip4Q9QXN3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trip4Q9QXN3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trip4Q9QXN3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trip4Q9QXN3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms