Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX98

Ptf1a, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptf1aQ9QX98 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ptf1aQ9QX98 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptf1aQ9QX98 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptf1aQ9QX98 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptf1aQ9QX98 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptf1aQ9QX98 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptf1aQ9QX98 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptf1aQ9QX98 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptf1aQ9QX98 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptf1aQ9QX98 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptf1aQ9QX98 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptf1aQ9QX98 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptf1aQ9QX98 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptf1aQ9QX98 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptf1aQ9QX98 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptf1aQ9QX98 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptf1aQ9QX98 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptf1aQ9QX98 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptf1aQ9QX98 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptf1aQ9QX98 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptf1aQ9QX98 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptf1aQ9QX98 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptf1aQ9QX98 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptf1aQ9QX98 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptf1aQ9QX98 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptf1aQ9QX98 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptf1aQ9QX98 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptf1aQ9QX98 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptf1aQ9QX98 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptf1aQ9QX98 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptf1aQ9QX98 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptf1aQ9QX98 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptf1aQ9QX98 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptf1aQ9QX98 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptf1aQ9QX98 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms