Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PdcQ9QW08 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms