Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rai2Q9QVY8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rai2Q9QVY8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms