Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hdgfl3Q9JMG7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl3Q9JMG7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms