Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG4

Nkain4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain4Q9JMG4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkain4Q9JMG4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkain4Q9JMG4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkain4Q9JMG4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkain4Q9JMG4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkain4Q9JMG4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkain4Q9JMG4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkain4Q9JMG4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkain4Q9JMG4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkain4Q9JMG4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nkain4Q9JMG4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nkain4Q9JMG4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nkain4Q9JMG4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nkain4Q9JMG4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nkain4Q9JMG4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nkain4Q9JMG4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nkain4Q9JMG4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nkain4Q9JMG4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nkain4Q9JMG4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nkain4Q9JMG4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nkain4Q9JMG4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nkain4Q9JMG4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nkain4Q9JMG4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nkain4Q9JMG4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nkain4Q9JMG4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nkain4Q9JMG4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nkain4Q9JMG4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms