Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms