Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Tnfrsf19Q9JLL3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfrsf19Q9JLL3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfrsf19Q9JLL3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Tnfrsf19Q9JLL3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf19Q9JLL3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf19Q9JLL3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf19Q9JLL3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf19Q9JLL3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfrsf19Q9JLL3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfrsf19Q9JLL3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Tnfrsf19Q9JLL3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfrsf19Q9JLL3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Tnfrsf19Q9JLL3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfrsf19Q9JLL3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnfrsf19Q9JLL3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Tnfrsf19Q9JLL3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Tnfrsf19Q9JLL3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Tnfrsf19Q9JLL3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfrsf19Q9JLL3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnfrsf19Q9JLL3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Tnfrsf19Q9JLL3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Tnfrsf19Q9JLL3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Tnfrsf19Q9JLL3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Tnfrsf19Q9JLL3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Tnfrsf19Q9JLL3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tnfrsf19Q9JLL3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Tnfrsf19Q9JLL3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Tnfrsf19Q9JLL3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Tnfrsf19Q9JLL3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Tnfrsf19Q9JLL3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfrsf19Q9JLL3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms