Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cabp1Q9JLK7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cabp1Q9JLK7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cabp1Q9JLK7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cabp1Q9JLK7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cabp1Q9JLK7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Cabp1Q9JLK7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cabp1Q9JLK7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cabp1Q9JLK7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cabp1Q9JLK7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cabp1Q9JLK7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cabp1Q9JLK7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cabp1Q9JLK7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cabp1Q9JLK7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cabp1Q9JLK7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cabp1Q9JLK7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cabp1Q9JLK7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cabp1Q9JLK7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cabp1Q9JLK7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cabp1Q9JLK7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cabp1Q9JLK7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cabp1Q9JLK7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cabp1Q9JLK7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cabp1Q9JLK7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cabp1Q9JLK7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cabp1Q9JLK7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cabp1Q9JLK7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cabp1Q9JLK7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cabp1Q9JLK7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Cabp1Q9JLK7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Cabp1Q9JLK7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cabp1Q9JLK7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cabp1Q9JLK7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cabp1Q9JLK7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Cabp1Q9JLK7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cabp1Q9JLK7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Cabp1Q9JLK7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cabp1Q9JLK7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cabp1Q9JLK7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cabp1Q9JLK7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cabp1Q9JLK7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cabp1Q9JLK7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cabp1Q9JLK7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cabp1Q9JLK7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cabp1Q9JLK7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cabp1Q9JLK7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cabp1Q9JLK7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cabp1Q9JLK7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cabp1Q9JLK7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cabp1Q9JLK7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cabp1Q9JLK7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cabp1Q9JLK7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cabp1Q9JLK7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cabp1Q9JLK7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cabp1Q9JLK7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cabp1Q9JLK7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cabp1Q9JLK7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cabp1Q9JLK7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cabp1Q9JLK7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cabp1Q9JLK7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cabp1Q9JLK7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Cabp1Q9JLK7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cabp1Q9JLK7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Cabp1Q9JLK7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cabp1Q9JLK7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cabp1Q9JLK7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cabp1Q9JLK7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cabp1Q9JLK7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cabp1Q9JLK7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cabp1Q9JLK7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cabp1Q9JLK7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms