Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tlr5Q9JLF7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tlr5Q9JLF7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms