Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms