Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ldb3Q9JKS4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms