Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chrac1Q9JKP8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chrac1Q9JKP8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms