Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cnga3Q9JJZ8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
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