Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms