Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gfra4Q9JJT2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gfra4Q9JJT2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gfra4Q9JJT2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gfra4Q9JJT2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gfra4Q9JJT2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gfra4Q9JJT2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gfra4Q9JJT2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gfra4Q9JJT2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gfra4Q9JJT2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gfra4Q9JJT2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gfra4Q9JJT2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gfra4Q9JJT2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gfra4Q9JJT2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gfra4Q9JJT2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gfra4Q9JJT2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gfra4Q9JJT2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gfra4Q9JJT2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gfra4Q9JJT2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gfra4Q9JJT2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gfra4Q9JJT2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gfra4Q9JJT2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gfra4Q9JJT2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gfra4Q9JJT2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gfra4Q9JJT2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gfra4Q9JJT2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gfra4Q9JJT2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gfra4Q9JJT2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gfra4Q9JJT2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gfra4Q9JJT2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gfra4Q9JJT2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gfra4Q9JJT2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gfra4Q9JJT2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gfra4Q9JJT2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gfra4Q9JJT2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gfra4Q9JJT2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gfra4Q9JJT2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gfra4Q9JJT2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gfra4Q9JJT2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gfra4Q9JJT2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gfra4Q9JJT2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gfra4Q9JJT2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gfra4Q9JJT2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gfra4Q9JJT2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gfra4Q9JJT2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gfra4Q9JJT2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gfra4Q9JJT2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gfra4Q9JJT2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gfra4Q9JJT2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gfra4Q9JJT2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gfra4Q9JJT2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gfra4Q9JJT2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms