Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnbip1Q9JJN6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnbip1Q9JJN6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnbip1Q9JJN6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnbip1Q9JJN6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnnbip1Q9JJN6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnnbip1Q9JJN6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnnbip1Q9JJN6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnnbip1Q9JJN6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnnbip1Q9JJN6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnnbip1Q9JJN6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms