Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN4

Oxct2a, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 2A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oxct2aQ9JJN4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Oxct2aQ9JJN4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Oxct2aQ9JJN4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Oxct2aQ9JJN4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Oxct2aQ9JJN4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Oxct2aQ9JJN4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Oxct2aQ9JJN4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Oxct2aQ9JJN4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Oxct2aQ9JJN4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Oxct2aQ9JJN4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Oxct2aQ9JJN4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Oxct2aQ9JJN4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Oxct2aQ9JJN4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Oxct2aQ9JJN4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Oxct2aQ9JJN4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Oxct2aQ9JJN4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Oxct2aQ9JJN4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Oxct2aQ9JJN4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Oxct2aQ9JJN4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Oxct2aQ9JJN4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Oxct2aQ9JJN4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Oxct2aQ9JJN4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Oxct2aQ9JJN4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Oxct2aQ9JJN4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Oxct2aQ9JJN4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Oxct2aQ9JJN4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Oxct2aQ9JJN4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Oxct2aQ9JJN4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Oxct2aQ9JJN4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Oxct2aQ9JJN4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Oxct2aQ9JJN4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Oxct2aQ9JJN4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Oxct2aQ9JJN4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Oxct2aQ9JJN4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Oxct2aQ9JJN4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Oxct2aQ9JJN4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Oxct2aQ9JJN4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Oxct2aQ9JJN4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Oxct2aQ9JJN4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Oxct2aQ9JJN4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Oxct2aQ9JJN4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Oxct2aQ9JJN4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Oxct2aQ9JJN4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Oxct2aQ9JJN4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Oxct2aQ9JJN4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Oxct2aQ9JJN4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Oxct2aQ9JJN4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms