Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJG6

Tmem47, Transmembrane protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem47Q9JJG6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem47Q9JJG6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem47Q9JJG6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem47Q9JJG6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem47Q9JJG6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem47Q9JJG6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem47Q9JJG6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem47Q9JJG6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem47Q9JJG6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem47Q9JJG6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem47Q9JJG6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem47Q9JJG6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem47Q9JJG6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem47Q9JJG6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem47Q9JJG6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem47Q9JJG6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem47Q9JJG6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem47Q9JJG6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem47Q9JJG6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem47Q9JJG6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem47Q9JJG6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem47Q9JJG6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem47Q9JJG6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem47Q9JJG6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem47Q9JJG6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem47Q9JJG6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem47Q9JJG6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem47Q9JJG6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem47Q9JJG6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem47Q9JJG6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem47Q9JJG6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem47Q9JJG6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem47Q9JJG6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem47Q9JJG6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem47Q9JJG6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem47Q9JJG6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem47Q9JJG6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem47Q9JJG6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem47Q9JJG6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem47Q9JJG6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem47Q9JJG6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem47Q9JJG6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem47Q9JJG6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem47Q9JJG6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem47Q9JJG6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem47Q9JJG6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem47Q9JJG6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem47Q9JJG6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tmem47Q9JJG6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem47Q9JJG6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem47Q9JJG6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem47Q9JJG6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem47Q9JJG6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem47Q9JJG6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem47Q9JJG6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem47Q9JJG6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem47Q9JJG6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem47Q9JJG6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem47Q9JJG6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem47Q9JJG6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem47Q9JJG6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem47Q9JJG6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem47Q9JJG6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem47Q9JJG6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem47Q9JJG6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem47Q9JJG6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem47Q9JJG6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem47Q9JJG6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem47Q9JJG6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem47Q9JJG6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem47Q9JJG6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem47Q9JJG6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem47Q9JJG6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem47Q9JJG6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem47Q9JJG6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem47Q9JJG6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem47Q9JJG6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem47Q9JJG6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem47Q9JJG6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem47Q9JJG6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem47Q9JJG6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem47Q9JJG6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem47Q9JJG6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem47Q9JJG6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem47Q9JJG6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem47Q9JJG6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem47Q9JJG6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem47Q9JJG6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem47Q9JJG6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem47Q9JJG6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem47Q9JJG6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem47Q9JJG6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem47Q9JJG6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem47Q9JJG6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem47Q9JJG6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem47Q9JJG6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem47Q9JJG6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem47Q9JJG6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem47Q9JJG6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem47Q9JJG6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms