Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smad9Q9JIW5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smad9Q9JIW5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms