Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG4

Ppp1r3f, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3fQ9JIG4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppp1r3fQ9JIG4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppp1r3fQ9JIG4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppp1r3fQ9JIG4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppp1r3fQ9JIG4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppp1r3fQ9JIG4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppp1r3fQ9JIG4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppp1r3fQ9JIG4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppp1r3fQ9JIG4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppp1r3fQ9JIG4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppp1r3fQ9JIG4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppp1r3fQ9JIG4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppp1r3fQ9JIG4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppp1r3fQ9JIG4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppp1r3fQ9JIG4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppp1r3fQ9JIG4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppp1r3fQ9JIG4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppp1r3fQ9JIG4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppp1r3fQ9JIG4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppp1r3fQ9JIG4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppp1r3fQ9JIG4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppp1r3fQ9JIG4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppp1r3fQ9JIG4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppp1r3fQ9JIG4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppp1r3fQ9JIG4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppp1r3fQ9JIG4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp1r3fQ9JIG4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms