Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LratQ9JI60 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LratQ9JI60 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LratQ9JI60 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LratQ9JI60 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LratQ9JI60 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LratQ9JI60 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LratQ9JI60 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LratQ9JI60 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LratQ9JI60 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LratQ9JI60 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LratQ9JI60 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LratQ9JI60 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LratQ9JI60 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LratQ9JI60 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LratQ9JI60 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LratQ9JI60 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LratQ9JI60 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LratQ9JI60 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LratQ9JI60 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LratQ9JI60 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LratQ9JI60 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LratQ9JI60 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LratQ9JI60 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LratQ9JI60 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LratQ9JI60 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LratQ9JI60 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LratQ9JI60 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LratQ9JI60 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LratQ9JI60 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LratQ9JI60 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LratQ9JI60 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LratQ9JI60 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LratQ9JI60 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LratQ9JI60 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LratQ9JI60 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LratQ9JI60 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LratQ9JI60 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LratQ9JI60 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms