Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmod3Q9JHJ0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmod3Q9JHJ0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmod3Q9JHJ0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmod3Q9JHJ0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmod3Q9JHJ0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmod3Q9JHJ0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmod3Q9JHJ0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmod3Q9JHJ0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmod3Q9JHJ0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmod3Q9JHJ0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Tmod3Q9JHJ0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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Tmod3Q9JHJ0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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Tmod3Q9JHJ0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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Tmod3Q9JHJ0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmod3Q9JHJ0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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