Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcirg1Q9JHF5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcirg1Q9JHF5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms