Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESM3

Hapln2, Hyaluronan and proteoglycan link protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln2Q9ESM3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hapln2Q9ESM3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hapln2Q9ESM3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hapln2Q9ESM3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hapln2Q9ESM3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hapln2Q9ESM3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hapln2Q9ESM3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hapln2Q9ESM3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hapln2Q9ESM3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hapln2Q9ESM3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hapln2Q9ESM3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hapln2Q9ESM3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hapln2Q9ESM3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hapln2Q9ESM3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hapln2Q9ESM3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hapln2Q9ESM3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hapln2Q9ESM3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms