Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tfip11Q9ERA6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tfip11Q9ERA6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tfip11Q9ERA6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tfip11Q9ERA6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tfip11Q9ERA6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tfip11Q9ERA6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tfip11Q9ERA6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tfip11Q9ERA6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tfip11Q9ERA6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tfip11Q9ERA6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tfip11Q9ERA6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tfip11Q9ERA6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tfip11Q9ERA6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tfip11Q9ERA6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tfip11Q9ERA6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tfip11Q9ERA6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tfip11Q9ERA6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tfip11Q9ERA6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tfip11Q9ERA6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tfip11Q9ERA6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tfip11Q9ERA6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tfip11Q9ERA6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tfip11Q9ERA6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tfip11Q9ERA6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tfip11Q9ERA6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tfip11Q9ERA6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tfip11Q9ERA6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tfip11Q9ERA6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tfip11Q9ERA6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tfip11Q9ERA6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms