Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Dap3Q9ER88 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms