Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cpsf1Q9EPU4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cpsf1Q9EPU4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cpsf1Q9EPU4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cpsf1Q9EPU4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cpsf1Q9EPU4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Cpsf1Q9EPU4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cpsf1Q9EPU4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cpsf1Q9EPU4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cpsf1Q9EPU4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cpsf1Q9EPU4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cpsf1Q9EPU4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cpsf1Q9EPU4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cpsf1Q9EPU4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cpsf1Q9EPU4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Cpsf1Q9EPU4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cpsf1Q9EPU4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Cpsf1Q9EPU4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cpsf1Q9EPU4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Cpsf1Q9EPU4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cpsf1Q9EPU4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cpsf1Q9EPU4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cpsf1Q9EPU4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cpsf1Q9EPU4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cpsf1Q9EPU4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cpsf1Q9EPU4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cpsf1Q9EPU4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cpsf1Q9EPU4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Cpsf1Q9EPU4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cpsf1Q9EPU4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cpsf1Q9EPU4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cpsf1Q9EPU4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cpsf1Q9EPU4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cpsf1Q9EPU4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cpsf1Q9EPU4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cpsf1Q9EPU4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cpsf1Q9EPU4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cpsf1Q9EPU4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cpsf1Q9EPU4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cpsf1Q9EPU4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Cpsf1Q9EPU4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cpsf1Q9EPU4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cpsf1Q9EPU4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cpsf1Q9EPU4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cpsf1Q9EPU4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cpsf1Q9EPU4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cpsf1Q9EPU4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cpsf1Q9EPU4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cpsf1Q9EPU4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cpsf1Q9EPU4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cpsf1Q9EPU4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cpsf1Q9EPU4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cpsf1Q9EPU4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cpsf1Q9EPU4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cpsf1Q9EPU4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cpsf1Q9EPU4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cpsf1Q9EPU4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cpsf1Q9EPU4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cpsf1Q9EPU4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cpsf1Q9EPU4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cpsf1Q9EPU4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cpsf1Q9EPU4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cpsf1Q9EPU4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cpsf1Q9EPU4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cpsf1Q9EPU4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cpsf1Q9EPU4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cpsf1Q9EPU4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cpsf1Q9EPU4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cpsf1Q9EPU4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cpsf1Q9EPU4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cpsf1Q9EPU4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cpsf1Q9EPU4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cpsf1Q9EPU4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cpsf1Q9EPU4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cpsf1Q9EPU4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cpsf1Q9EPU4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Cpsf1Q9EPU4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cpsf1Q9EPU4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cpsf1Q9EPU4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cpsf1Q9EPU4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cpsf1Q9EPU4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cpsf1Q9EPU4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cpsf1Q9EPU4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cpsf1Q9EPU4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cpsf1Q9EPU4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Cpsf1Q9EPU4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cpsf1Q9EPU4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cpsf1Q9EPU4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cpsf1Q9EPU4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cpsf1Q9EPU4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cpsf1Q9EPU4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cpsf1Q9EPU4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cpsf1Q9EPU4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cpsf1Q9EPU4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cpsf1Q9EPU4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cpsf1Q9EPU4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Cpsf1Q9EPU4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cpsf1Q9EPU4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cpsf1Q9EPU4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cpsf1Q9EPU4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms