Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPS6

Vmn1r171, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r171Q9EPS6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r171Q9EPS6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r171Q9EPS6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r171Q9EPS6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r171Q9EPS6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r171Q9EPS6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r171Q9EPS6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r171Q9EPS6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r171Q9EPS6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r171Q9EPS6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r171Q9EPS6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r171Q9EPS6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r171Q9EPS6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r171Q9EPS6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r171Q9EPS6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r171Q9EPS6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r171Q9EPS6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r171Q9EPS6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r171Q9EPS6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r171Q9EPS6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r171Q9EPS6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r171Q9EPS6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r171Q9EPS6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r171Q9EPS6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r171Q9EPS6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r171Q9EPS6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r171Q9EPS6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r171Q9EPS6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r171Q9EPS6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r171Q9EPS6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r171Q9EPS6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r171Q9EPS6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r171Q9EPS6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r171Q9EPS6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r171Q9EPS6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r171Q9EPS6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r171Q9EPS6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r171Q9EPS6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r171Q9EPS6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r171Q9EPS6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r171Q9EPS6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r171Q9EPS6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r171Q9EPS6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r171Q9EPS6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r171Q9EPS6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r171Q9EPS6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r171Q9EPS6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms