Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clstn1Q9EPL2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms