Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB8

Vmn1r54, Vomeronasal type-1 receptor 54, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r54Q9EPB8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r54Q9EPB8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r54Q9EPB8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r54Q9EPB8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r54Q9EPB8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r54Q9EPB8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r54Q9EPB8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r54Q9EPB8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r54Q9EPB8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r54Q9EPB8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r54Q9EPB8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r54Q9EPB8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r54Q9EPB8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r54Q9EPB8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r54Q9EPB8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r54Q9EPB8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r54Q9EPB8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r54Q9EPB8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r54Q9EPB8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r54Q9EPB8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r54Q9EPB8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r54Q9EPB8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r54Q9EPB8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r54Q9EPB8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms