Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syde1Q9DBZ9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms