Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx6Q9DBY5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms