Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY0

Foxp4, Forkhead box protein P4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp4Q9DBY0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Foxp4Q9DBY0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Foxp4Q9DBY0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Foxp4Q9DBY0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Foxp4Q9DBY0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Foxp4Q9DBY0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Foxp4Q9DBY0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Foxp4Q9DBY0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Foxp4Q9DBY0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Foxp4Q9DBY0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Foxp4Q9DBY0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Foxp4Q9DBY0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Foxp4Q9DBY0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Foxp4Q9DBY0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Foxp4Q9DBY0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Foxp4Q9DBY0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Foxp4Q9DBY0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Foxp4Q9DBY0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Foxp4Q9DBY0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Foxp4Q9DBY0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Foxp4Q9DBY0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Foxp4Q9DBY0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Foxp4Q9DBY0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Foxp4Q9DBY0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Foxp4Q9DBY0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Foxp4Q9DBY0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Foxp4Q9DBY0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Foxp4Q9DBY0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Foxp4Q9DBY0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Foxp4Q9DBY0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Foxp4Q9DBY0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Foxp4Q9DBY0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Foxp4Q9DBY0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Foxp4Q9DBY0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Foxp4Q9DBY0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Foxp4Q9DBY0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Foxp4Q9DBY0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Foxp4Q9DBY0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Foxp4Q9DBY0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Foxp4Q9DBY0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Foxp4Q9DBY0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Foxp4Q9DBY0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Foxp4Q9DBY0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Foxp4Q9DBY0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Foxp4Q9DBY0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Foxp4Q9DBY0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Foxp4Q9DBY0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Foxp4Q9DBY0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Foxp4Q9DBY0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Foxp4Q9DBY0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Foxp4Q9DBY0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Foxp4Q9DBY0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Foxp4Q9DBY0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Foxp4Q9DBY0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Foxp4Q9DBY0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Foxp4Q9DBY0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Foxp4Q9DBY0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Foxp4Q9DBY0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Foxp4Q9DBY0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Foxp4Q9DBY0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Foxp4Q9DBY0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Foxp4Q9DBY0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Foxp4Q9DBY0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Foxp4Q9DBY0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Foxp4Q9DBY0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Foxp4Q9DBY0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Foxp4Q9DBY0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Foxp4Q9DBY0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Foxp4Q9DBY0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Foxp4Q9DBY0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Foxp4Q9DBY0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Foxp4Q9DBY0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Foxp4Q9DBY0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Foxp4Q9DBY0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Foxp4Q9DBY0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Foxp4Q9DBY0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Foxp4Q9DBY0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Foxp4Q9DBY0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Foxp4Q9DBY0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Foxp4Q9DBY0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Foxp4Q9DBY0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Foxp4Q9DBY0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Foxp4Q9DBY0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Foxp4Q9DBY0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Foxp4Q9DBY0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Foxp4Q9DBY0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Foxp4Q9DBY0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Foxp4Q9DBY0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Foxp4Q9DBY0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Foxp4Q9DBY0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Foxp4Q9DBY0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Foxp4Q9DBY0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Foxp4Q9DBY0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Foxp4Q9DBY0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Foxp4Q9DBY0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Foxp4Q9DBY0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Foxp4Q9DBY0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Foxp4Q9DBY0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Foxp4Q9DBY0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Foxp4Q9DBY0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms