Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc97Q9DBT3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms