Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBA6

Tysnd1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tysnd1Q9DBA6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tysnd1Q9DBA6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tysnd1Q9DBA6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tysnd1Q9DBA6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tysnd1Q9DBA6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tysnd1Q9DBA6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tysnd1Q9DBA6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tysnd1Q9DBA6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tysnd1Q9DBA6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tysnd1Q9DBA6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tysnd1Q9DBA6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tysnd1Q9DBA6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tysnd1Q9DBA6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tysnd1Q9DBA6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tysnd1Q9DBA6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tysnd1Q9DBA6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tysnd1Q9DBA6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tysnd1Q9DBA6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tysnd1Q9DBA6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tysnd1Q9DBA6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tysnd1Q9DBA6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tysnd1Q9DBA6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tysnd1Q9DBA6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tysnd1Q9DBA6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tysnd1Q9DBA6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tysnd1Q9DBA6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tysnd1Q9DBA6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tysnd1Q9DBA6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tysnd1Q9DBA6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tysnd1Q9DBA6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tysnd1Q9DBA6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tysnd1Q9DBA6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms