Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAE8

UPF0739 protein C1orf74 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAE8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9DAE8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9DAE8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9DAE8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9DAE8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9DAE8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9DAE8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9DAE8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms