Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samd8Q9DA37 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Samd8Q9DA37 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd8Q9DA37 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd8Q9DA37 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd8Q9DA37 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd8Q9DA37 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd8Q9DA37 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd8Q9DA37 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd8Q9DA37 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd8Q9DA37 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd8Q9DA37 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd8Q9DA37 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd8Q9DA37 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd8Q9DA37 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Samd8Q9DA37 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samd8Q9DA37 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samd8Q9DA37 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Samd8Q9DA37 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samd8Q9DA37 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samd8Q9DA37 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samd8Q9DA37 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samd8Q9DA37 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Samd8Q9DA37 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samd8Q9DA37 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samd8Q9DA37 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samd8Q9DA37 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd8Q9DA37 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd8Q9DA37 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd8Q9DA37 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd8Q9DA37 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd8Q9DA37 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd8Q9DA37 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd8Q9DA37 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd8Q9DA37 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd8Q9DA37 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd8Q9DA37 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd8Q9DA37 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd8Q9DA37 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd8Q9DA37 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd8Q9DA37 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd8Q9DA37 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd8Q9DA37 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd8Q9DA37 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd8Q9DA37 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd8Q9DA37 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd8Q9DA37 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms