Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sgf29Q9DA08 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms