Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp12Q9D9M2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp12Q9D9M2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp12Q9D9M2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp12Q9D9M2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp12Q9D9M2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp12Q9D9M2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp12Q9D9M2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp12Q9D9M2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp12Q9D9M2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp12Q9D9M2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp12Q9D9M2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp12Q9D9M2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp12Q9D9M2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp12Q9D9M2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp12Q9D9M2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp12Q9D9M2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp12Q9D9M2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp12Q9D9M2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp12Q9D9M2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp12Q9D9M2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp12Q9D9M2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp12Q9D9M2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp12Q9D9M2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Usp12Q9D9M2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp12Q9D9M2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp12Q9D9M2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp12Q9D9M2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp12Q9D9M2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp12Q9D9M2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp12Q9D9M2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp12Q9D9M2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp12Q9D9M2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp12Q9D9M2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp12Q9D9M2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp12Q9D9M2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp12Q9D9M2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp12Q9D9M2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp12Q9D9M2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp12Q9D9M2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp12Q9D9M2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
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Usp12Q9D9M2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp12Q9D9M2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp12Q9D9M2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp12Q9D9M2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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