Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg7Q9D906 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg7Q9D906 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg7Q9D906 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg7Q9D906 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg7Q9D906 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg7Q9D906 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg7Q9D906 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg7Q9D906 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg7Q9D906 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg7Q9D906 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg7Q9D906 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg7Q9D906 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg7Q9D906 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg7Q9D906 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg7Q9D906 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg7Q9D906 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg7Q9D906 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg7Q9D906 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg7Q9D906 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg7Q9D906 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg7Q9D906 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg7Q9D906 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg7Q9D906 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg7Q9D906 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg7Q9D906 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg7Q9D906 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg7Q9D906 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg7Q9D906 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg7Q9D906 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg7Q9D906 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg7Q9D906 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg7Q9D906 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg7Q9D906 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg7Q9D906 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg7Q9D906 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg7Q9D906 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg7Q9D906 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg7Q9D906 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg7Q9D906 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg7Q9D906 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg7Q9D906 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg7Q9D906 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg7Q9D906 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg7Q9D906 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg7Q9D906 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg7Q9D906 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg7Q9D906 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg7Q9D906 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg7Q9D906 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg7Q9D906 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg7Q9D906 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg7Q9D906 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms