Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms