Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S3

Arfgap3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgap3Q9D8S3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arfgap3Q9D8S3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arfgap3Q9D8S3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arfgap3Q9D8S3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arfgap3Q9D8S3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arfgap3Q9D8S3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Arfgap3Q9D8S3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arfgap3Q9D8S3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgap3Q9D8S3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgap3Q9D8S3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgap3Q9D8S3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgap3Q9D8S3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgap3Q9D8S3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgap3Q9D8S3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgap3Q9D8S3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgap3Q9D8S3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgap3Q9D8S3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgap3Q9D8S3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgap3Q9D8S3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgap3Q9D8S3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgap3Q9D8S3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgap3Q9D8S3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgap3Q9D8S3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgap3Q9D8S3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgap3Q9D8S3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgap3Q9D8S3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgap3Q9D8S3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgap3Q9D8S3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgap3Q9D8S3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgap3Q9D8S3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgap3Q9D8S3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgap3Q9D8S3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgap3Q9D8S3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgap3Q9D8S3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgap3Q9D8S3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgap3Q9D8S3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Arfgap3Q9D8S3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgap3Q9D8S3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgap3Q9D8S3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgap3Q9D8S3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfgap3Q9D8S3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfgap3Q9D8S3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfgap3Q9D8S3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms